USBの容量制限は特にありませんが、フォルダ数とファイル数に制限があります。
1フォルダ内の最大ファイル数：9999
1フォルダ内の最大フォルダ数：9999 

※フォルダ階層数はルートを含めて8階層になります。ただし、制限内でもフォルダ名/ファイル
   名が最大文字数（全角80 文字）を超える場合は認識できません。
※デバイス内の最大フォルダ数/最大ファイル数に制限はありませんがデバイスの容量やファイル
   システムによって制限を受ける場合があります。